A neonatológia a csikók újszülött kori betegségeivel foglalkozik. Tágabb szakmai értelemben a neonatológia lényege, hogy minden választás előtti csikót eltérően kell kezelni a kifejlett állattól. A csikóknak a felnőtt állattól eltérő betegségei vannak, ami eltérő kezelési sémákat is jelent. A csikók kezelése igen nagy tapasztalatot és gyors beavatkozást igényel, mivel állapotuk sokkal gyorsabban tud romlani, mint felnőtt társaiké.